Aktivitätsort-Kartierung

Die präzise Charakterisierung des aktiven Zentrums eines Enzyms ist entscheidend für das Verständnis seines katalytischen Mechanismus, seiner Substratspezifität und seines Potenzials für das Engineering. Bei Creative Enzymes bietet unser Active Site Mapping-Service umfassende Einblicke in die molekulare Architektur, Schlüsselfunktionen und funktionelle Dynamik von Enzym-Aktivzentren. Durch die Kombination fortschrittlicher experimenteller und computergestützter Techniken ermöglichen wir es unseren Kunden, kritische Aminosäuren zu identifizieren, Bindungstaschen abzugrenzen und das rationale Design von Inhibitoren, Substraten oder modifizierten Enzymen zu steuern.

Warum das Enzym-Aktivzentrum untersuchen

Enzym-Aktivzentren sind die zentralen Orte, an denen Substrate binden und Reaktionen ablaufen. Kenntnisse über die Architektur des aktiven Zentrums und funktionelle Aminosäuren sind unerlässlich, um Reaktionsmechanismen aufzuklären, Substratkompatibilität vorherzusagen und gezielte Modulatoren zu entwickeln. Traditionelle Methoden wie Mutagenese und kinetische Analysen bieten, in Kombination mit modernen spektroskopischen und computergestützten Ansätzen, eine beispiellose Auflösung bei der Identifizierung kritischer Wechselwirkungen im aktiven Zentrum. Das Mapping des aktiven Zentrums dient somit als grundlegendes Werkzeug in der Biokatalyse, Wirkstoffforschung und Protein-Engineering.

Abbildung 1. Die distalen Bereiche, die für die Enzymfunktion wichtig sind. A, distale Hotspots, die mit dem aktiven Zentrum gekoppelt sind. B, Funktionelle Mutationen, die distal vom TEM-1-Aktivzentrum liegen. (Yu et al., 2022)

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Service-Details

Creative Enzymes bietet einen umfassenden und anpassbaren Active Site Mapping-Service, der experimentelle, computergestützte und analytische Ansätze umfasst:

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Repräsentative Fallstudien

FAQs

• F: Welche Enzyme können mit Ihrem Active Site Mapping-Service analysiert werden?

  A: Wir können ein breites Spektrum an Enzymen analysieren, darunter Hydrolasen, Oxidoreduktasen, Transferasen, Lyasen und Ligasen, sowohl für natürliche als auch für modifizierte Varianten.

• F: Wie lange dauert das Active Site Mapping in der Regel?

  A: Die Dauer variiert je nach Enzymkomplexität und Projektumfang, typischerweise zwischen 6 und 10 Wochen. Für dringende Projekte sind beschleunigte Services verfügbar.

• F: Werden gereinigte Enzyme benötigt?

  A: Ja, gereinigte Enzyme mit bestätigter Aktivität sind bevorzugt. Wir können bei Bedarf einen Enzymreinigungsservice anbieten.

• F: Können Ihre Ergebnisse das Design von Wirkstoffen oder Inhibitoren unterstützen?

  A: Absolut. Die Identifizierung funktioneller Aminosäuren und Bindungstaschen ermöglicht das rationale Design von Inhibitoren und strukturgeleitete Wirkstoffentwicklung.

• F: Welche Ergebnisse werden geliefert?

  A: Kunden erhalten einen detaillierten Bericht, 3D-Visualisierungen der aktiven Zentren, Roh- und verarbeitete experimentelle Daten, Computermodelle und umsetzbare Empfehlungen.

• F: Bieten Sie eine Nachberatung an?

  A: Ja, unser Team bietet Unterstützung bei der Interpretation der Ergebnisse, der Planung weiterer Experimente und der Anwendung der Erkenntnisse im Enzym-Engineering oder in der therapeutischen Entwicklung.