Metagenom-Screening für Enzyme

Über Metagenom-Screening für Enzyme

Bei der Enzymentdeckung ermöglicht die Metagenomik die Analyse von DNA-Sequenzen aus der Umwelt auf eine hochdurchsatzfähige Weise. Genomdatenbanken können auf Informationen über die Arten und die enzymatischen Aktivitäten, die in der Probe vorhanden sind, untersucht werden. Für nicht kultivierbare Mikroorganismen, da eine Kultur in der Metagenomik nicht erforderlich ist, eröffnet dies die Möglichkeit, ein riesiges Reservoir neuer, bisher unbekannter Enzyme zu erkunden, beispielsweise mit bekannten Aktivitäten, aber ungewöhnlichen Eigenschaften und/oder mit unbekannten Aktivitäten gegenüber spezifischen Substraten. Metagenomik wurde erfolgreich genutzt, um neuartige Enzyme aus verschiedenen natürlichen Quellen, wie Boden- und Meeresumgebungen, zu erforschen. Als typisches Beispiel wurde α-Xylosidase aus einem Bodenmetagenom gescreent, identifiziert und charakterisiert. In dieser Studie wurde die metagenomische DNA zunächst aus der Bodenprobe extrahiert. Eine metagenomische Bibliothek wurde konstruiert und in E. coli transformiert, gefolgt von einem Screening auf Aktivität. In einem weiteren Beispiel wurden Gene für die Produktion sekundärer Metaboliten aus Pilzstämmen identifiziert, die aus natürlichen Quellen gesammelt wurden. Mit Hilfe der genomischen DNA-Sequenzierung wurde das Gen durch Genlöschung oder -störung gezielt, gefolgt von der Erkennung des Verlusts der Produktion des Zielverbindung. Der gezielte Gencluster wurde validiert und durch heterologe Expression charakterisiert.

Creative Enzymes ist ein führendes Unternehmen, das sich auf enzymbezogene Lösungen spezialisiert hat. Wir sind bestrebt, unseren Kunden weltweit innovative Enzymprodukte und -dienstleistungen anzubieten. Im Bereich des Metagenom-Screenings wenden wir unsere fortschrittliche Technologie und Expertise an, um neuartige Enzyme mit einzigartigen Funktionen und Potenzial für eine Vielzahl von Anwendungen zu entdecken und zu entwickeln.

Unser Serviceprozess

1. Probenentnahme und -verarbeitung

Wir bieten professionelle Anleitung und Unterstützung, um sicherzustellen, dass Sie Proben sammeln, die für das Screening geeignet sind. Die Proben können aus verschiedenen mikrobiellen Umgebungen stammen, wie terrestrischen, aquatischen, parasitären, künstlichen und anderen spezialisierten Umgebungen.

2. DNA-Extraktion und Bibliothekskonstruktion

Wir verwenden fortschrittliche DNA-Extraktionstechniken, um die gesamte DNA mikrobieller Gemeinschaften aus den Proben unter Verwendung direkter und indirekter Extraktionsmethoden zu extrahieren, gefolgt von der Ligation der extrahierten genomischen DNA in geeignete Vektoren und der Transformation der Wirtsbakterien zur Konstruktion makrogenomischer Bibliotheken für nachfolgende Screening-Analysen.

3. Enzym-Screening

Matagenom-Mining neuartiger Biokatalysatoren umfasst aktivitätsbasiertes Screening und sequenzbasiertes Screening.

• Sequenzbasiertes Screening (keine Abhängigkeit von der Expression rekombinanter Gene in exogenen Wirten)
  Durch das Entwerfen von Sequenzsonden oder PCR-Primern für bekannte funktionale Gene verlassen wir uns auf die DNA-Sequenz des konservierten Bereichs des Zielgens für Hybridisierung oder PCR-Amplifikations-Screening, um das Zielgen zu erhalten, und dann heterologe Expression des Zielgens, um biologisch aktive Metaboliten zu erhalten.
• Funktionsbasiertes Screening (nicht abhängig von bekannten Sequenzinformationen)
  Wir screenen direkt basierend auf den Eigenschaften, die von den Zielklonen in der Bibliothek auf selektiven Medien ausgedrückt werden.

4. Molekulare und biochemische Charakterisierung

Wir suchen nach ORF, katalytischer Aktivität, Substratspezifität, Toleranz und anderen Eigenschaften durch Sequenzierung.

Warum unseren Service wählen?

• Führende Technologie: Mit fortschrittlicher makrogenomischer Technologie und professioneller Erfahrung im Enzym-Screening können wir qualitativ hochwertige und effiziente Dienstleistungen anbieten.
• Vielfältige Ressourcen: Wir können Proben aus verschiedenen Umgebungen screenen und vielfältige Enzymressourcen erhalten, die mehr Auswahlmöglichkeiten für Ihre Forschung und Anwendung bieten.
• Individuelle Anpassung: Wir entwickeln individuelle experimentelle Pläne und Strategien entsprechend Ihren Projektbedürfnissen und -zielen, um die besten Screening-Ergebnisse zu erzielen.
• Professionelles Team: Wir haben ein professionelles Team von Wissenschaftlern mit umfangreicher Erfahrung im Enzym-Screening und in der Molekularbiologie, das umfassende technische Unterstützung und Lösungen bieten kann.
• Vertraulichkeit und Zuverlässigkeit: Wir halten die Vertraulichkeitsanforderungen unserer Kunden strikt ein und gewährleisten die Sicherheit und Zuverlässigkeit der Daten.

Wir bieten Dienstleistungen für das Enzym-Metagenom-Screening an, die darauf abzielen, neuartige Enzyme mit spezifischen katalytischen Aktivitäten und Funktionen aus einer Vielzahl von Umweltproben zu entdecken. Wenn Sie an Metagenom-Screening für Enzymdienstleistungen oder anderen enzymbezogenen Bedürfnissen interessiert sind, kontaktieren Sie bitte unser Kundenserviceteam. Wir freuen uns darauf, mit Ihnen zusammenzuarbeiten, um hervorragende Unterstützung und Dienstleistungen für Ihre Forschung und Anwendungen bereitzustellen.

Abbildung 1 Konstruktion und Screening von metagenomischen Bibliotheken.
(Mikrobiologie und Molekularbiologie Reviews 2004)