Dienstleistungen

Professionelle und kostensparende Lösungen

Rechnerische und technische Unterstützung für Hochdurchsatz-Inhibitor-Screening

Bei Creative Enzymes erkennen wir, dass der Erfolg von High-Throughput Screening (HTS) lange vor dem Testen der Verbindungen im Labor beginnt. Unser Service für Computational and Technical Support bietet Kunden die essenzielle Grundlage für effiziente, zielgerichtete und wissenschaftlich fundierte HTS-Kampagnen. Durch eine Kombination aus computergestütztem Modellieren, in silico-Vorhersagen und fachkundiger technischer Beratung optimieren wir das Design von Inhibitorbibliotheken, rationalisieren die Entwicklung von Assays und sorgen für eine effiziente Ressourcenzuteilung. Diese Pre-Screening-Unterstützung steigert die Trefferquote erheblich und senkt die nachgelagerten Kosten.

Hintergrund zu Computational and Technical Support für High-Throughput-Inhibitor-Screening

HTS ist zu einem Grundpfeiler der Inhibitordiscovery geworden und ermöglicht die schnelle Auswertung von Tausenden Verbindungen über verschiedene Enzymziele hinweg. Großangelegte Screenings können jedoch ressourcenintensiv sein, und ohne sorgfältige Planung liefern viele Kampagnen Treffer mit geringem Wert oder unklare Daten. Computergestützte Ansätze wie molekulares Docking, virtuelles Screening, Pharmakophor-Modellierung und prädiktive ADMET-Analyse bieten einen leistungsstarken ersten Filter, um Verbindungen mit höheren Erfolgschancen zu priorisieren.

Computational and technical support for high-throughput inhibitor screening (adapted from Lamba and Pesaresi, 2022)

Ebenso wichtig ist die technische Beratung, um Assay-Bedingungen zu definieren, geeignete Kontrollen auszuwählen und Reproduzierbarkeit in automatisierten Workflows sicherzustellen. Durch die Kombination von computergestützter und experimenteller Expertise bietet Creative Enzymes ein integriertes Unterstützungssystem, das die Grundlage für robuste HTS-Projekte legt.

Warum Computational and Technical Support entscheidend ist

Aspekt Mit Computational & Technical Support Ohne Computational & Technical Support
Verbindungsauswahl Priorisierung durch Docking, Pharmakophor-Modellierung und ADMET-Filterung
→ kleinere, hochwertigere Sets
Große, unspezifische Bibliotheken werden blind gescreent
→ höhere Kosten und Zeitaufwand
Trefferquote Angereicherte Bibliotheken erhöhen die Wahrscheinlichkeit, aktive Inhibitoren zu identifizieren Niedrigere Trefferquote durch ungefiltertes oder zufälliges Screening
Assay-Entwicklung Individuelle Beratung zu Substraten, Kontrollen und Bedingungen gewährleistet robuste, reproduzierbare Assays Trial-and-Error-Ansatz beim Assay-Aufbau
→ höhere Variabilität und inkonsistente Ergebnisse
Ressourceneffizienz Optimierte Experimente senken Kosten, Reagenzienverbrauch und Automatisierungszeit Verschwendung von Ressourcen für das Screening von Kandidaten mit geringer Wahrscheinlichkeit
Zeitleiste Schnellerer Übergang von der Bibliotheksauswahl zu validierten Treffern Verlängerte Projektdauer durch wiederholte Tests und erneute Optimierung
Integration in den HTS-Workflow Nahtloser Übergang von in silico-Vorhersagen zu automatisiertem HTS Keine Verbindung zwischen computergestützten Vorhersagen und experimentellen Tests

Unsere umfassenden Support-Services

Unsere Computational and Technical Support-Dienstleistungen konzentrieren sich auf drei Hauptsäulen:

Computational Modeling & Prediction

  • Virtuelles Screening großer Bibliotheken zur Rangordnung von Verbindungen nach vorhergesagter Bindungsaffinität.
  • Molekulares Docking zur Modellierung von Inhibitor–Enzym-Interaktionen und Identifizierung wichtiger Bindungsreste.
  • Pharmakophor-Modellierung zur Hervorhebung struktureller Motive, die für die Inhibition entscheidend sind.
  • In silico ADMET-Bewertung zur Vorhersage von Löslichkeit, Stabilität und potenzieller Toxizität.

Technische Beratung

  • Beratung zum experimentellen Design, einschließlich Enzymauswahl, Substratoptimierung und Assay-Format.
  • Empfehlungen zur Automatisierungskompatibilität für High-Throughput-Workflows.
  • Vorschläge für positive/negative Kontrollen und Referenzinhibitoren.
  • Risikoabschätzung zur Identifizierung potenzieller Herausforderungen bei der Reproduzierbarkeit von Assays

Integration in den HTS-Workflow

  • Nahtlose Verbindung zwischen computergestützten Vorhersagen und Laborversuchen.
  • Priorisierung von Verbindungssubsets für effizientes Screening.
  • Laufende Unterstützung während der Assay-Entwicklungsphase.

Kontaktieren Sie unser Team

Blick nach vorn: Der vollständige Workflow für High-Throughput-Screening von Inhibitoren

Über die computergestützte und technische Unterstützung hinaus bietet Creative Enzymes einen umfassenden, durchgängigen High-Throughput-Screening (HTS)-Prozess für Enzyminhibitoren. Unsere Dienstleistungen sind in spezialisierte Module gegliedert, sodass Kunden gezielt die benötigte Unterstützung wählen oder dem vollständigen Workflow nahtlos folgen können:

Comprehensive workflow for high-throughput screening of enzyme inhibitors

Erstellung von Inhibitorbibliotheken für High-Throughput-Screening

Entwerfen oder nutzen Sie maßgeschneiderte Verbindungsbibliotheken für Ihre Zielenzyme.

Anfrage

High-Throughput-Inhibitor-Assays und Screening

Führen Sie automatisierte, skalierbare Assays durch, um Tausende Kandidaten schnell zu bewerten.

Anfrage

Bestimmung und Messung der Inhibitoraktivität

Quantifizieren Sie präzise Potenz, Spezifität und kinetische Parameter der identifizierten Treffer.

Anfrage

Warum Creative Enzymes wählen

Integrierter computergestützter–experimenteller Ansatz

Gewährleistet einen reibungslosen Übergang von in silico-Vorhersagen zu experimentellen Assays.

Breite Enzymabdeckung

Modellierung und Beratung für verschiedene Enzymklassen, von Kinasen bis Glycosidasen.

Individuelle Empfehlungen

Maßgeschneiderte Beratung basierend auf den spezifischen Forschungszielen des Kunden.

Effizienz und Kostenreduktion

Priorisierung von Verbindungssubsets reduziert unnötige Screening-Kosten.

Modernste computergestützte Tools

Zugang zu molekularem Docking, Pharmakophor-Modellierung und prädiktiven ADMET-Plattformen.

Fachkundige Beratung

Unsere Enzymologie-Experten bieten praktische, praxisnahe Beratung für Assay-Entwicklung und Workflow-Optimierung.

Fallstudien und Erfolgsgeschichten

Fall 1: Pre-Screening für Deacetylase-Inhibitoren

Kundenbedarf:

Ein Pharmaunternehmen wollte neuartige Deacetylase-Inhibitoren entdecken, stand jedoch vor Herausforderungen bei der Kosten- und Zeitkontrolle für das Screening einer sehr großen Verbindungsbibliothek.

Unser Ansatz:

Wir setzten molekulares Docking, virtuelles Screening und Pharmakophor-Modellierung ein, um 5.000 Kandidatenverbindungen vorzuscreenen. Durch computergestützte Rangordnung identifizierten wir die 500 vielversprechendsten Kandidaten, die voraussichtlich stark mit dem aktiven Zentrum der Deacetylase interagieren. Diese priorisierten Verbindungen wurden dem HTS zugeführt, was die unnötige experimentelle Arbeitsbelastung erheblich reduzierte.

Ergebnis:

Das HTS zeigte eine deutlich höhere Trefferquote im computergestützt angereicherten Set im Vergleich zum zufälligen Screening. Der Kunde konnte mehrere Leitstrukturen in die SAR-Optimierung überführen und sparte so Zeit und Ressourcen.

Fall 2: Optimierung von Lipase-Assays für High-Throughput-Screening

Kundenbedarf:

Ein Unternehmen der Lebensmittelbiotechnologie benötigte zuverlässige, HTS-kompatible Lipase-Inhibitionsassays zur Unterstützung großangelegter Screenings. Ihr Hauptanliegen war die Reproduzierbarkeit über Tausende Wells unter automatisierten Bedingungen.

Unser Ansatz:

Unser technisches Team optimierte die Assay-Bedingungen, wählte sorgfältig Substrate, Puffersysteme und Referenzkontrollen aus, um Robustheit zu gewährleisten. Wir gaben zudem Empfehlungen zur Integration in die Automatisierung, damit der Assay auch unter High-Throughput-Roboterbedingungen konsistent blieb.

Ergebnis:

Der optimierte Assay lieferte reproduzierbare Ergebnisse über große Verbindungsmengen hinweg und ermöglichte dem Kunden ein Screening im großen Maßstab mit Vertrauen. Diese Zuverlässigkeit reduzierte falsch-positive Ergebnisse und sorgte für eine reibungslosere Validierung der Treffer.

FAQs zu Computational and Technical Support für Inhibitor-HTS

  • F: Welche computergestützten Tools verwenden Sie für das Pre-Screening?

    A: Wir nutzen eine Kombination aus molekularem Docking, virtuellem Screening, Pharmakophor-Modellierung und in silico ADMET-Analyse. Diese Methoden ermöglichen es uns, Verbindungen nach vorhergesagter Bindungsaffinität zu bewerten und ihre drug-like Eigenschaften einzuschätzen.
  • F: Können Sie vom Kunden bereitgestellte Verbindungsbibliotheken in den computergestützten Workflow integrieren?

    A: Absolut. Wir können mit kundeneigenen Bibliotheken, vorgefertigten Bibliotheken von unserer Plattform oder mit Hybridbibliotheken für spezifische Ziele arbeiten.
  • F: Wie verbessert die technische Beratung die HTS-Ergebnisse?

    A: Unsere Beratung stellt sicher, dass Assay-Design, Substratauswahl und Automatisierungs-Workflows optimiert sind. Dies reduziert experimentelle Variabilität und erhöht die Effizienz der Trefferidentifikation.
  • F: Wie stellen Sie sicher, dass computergestützte Vorhersagen mit experimentellen Ergebnissen übereinstimmen?

    A: Wir integrieren computergestützte Daten mit experimenteller Validierung. Durch die Priorisierung von Verbindungen und das Design von Assays basierend auf vorhergesagten Bindungsmodi schaffen wir einen synergetischen Workflow, der in silico- und Laborergebnisse verbindet.
  • F: Für welche Enzymziele eignet sich das computergestützte Pre-Screening am besten?

    A: Die meisten Enzymfamilien – einschließlich Kinasen, Proteasen, Lipasen, Esterasen, Glycosidasen und neue Ziele – sind geeignet. Für neuartige Enzyme können wir Strukturmodelle auf Basis von Homologie erstellen.

Referenz:

  1. Lamba D, Pesaresi A. Kinetic modeling of time-dependent enzyme inhibition by pre-steady-state analysis of progress curves: the case study of the anti-Alzheimer's drug galantamine. IJMS. 2022;23(9):5072. doi:10.3390/ijms23095072

Nur für Forschungs- und Industriezwecke. Nicht für den persönlichen Gebrauch bestimmt. Bestimmte Produkte in Lebensmittelqualität eignen sich für die Formulierungsentwicklung in Lebensmitteln und verwandten Anwendungen.

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